Alterre Bourgogne intervient en priorité sur certaines thématiques environnementales. Selon les thématiques, l'agence met à disposition des données issues de ses travaux d'observation, effectue un travail de sensibilisation, joue un rôle de coordination entre les acteurs concernés ou encore, accompagne dans la mise en oeuvre d'actions diverses. Au rang des thématiques prioritaires, figurent les suivantes :

Action collective et développement durable

Adaptation au changement climatique

Agendas 21

Biodiversité

Commande publique durable

Ecologie territoriale

Eau douce et protection de captages

Mobilité durable

Pesticides

Prévention des déchets

Qualité environnementale des bâtiments

Vulnérabilité énergétique 

Pour chacun de ces thèmes, un ensemble de ressources sont mises à votre disposition, pour vous permettre de mieux comprendre les grands enjeux et de vous accompagner dans votre réflexion et votre passage à l'action. Sont également indiqués les partenaires avec un lien vers leur site Internet, ainsi que le nom et les coordonnées du chargé de mission d'Alterre qui peut vous apporter un complément d'information et répondre à vos question.